Jest chemicznym związkiem organicznym pozyskiwanym z niektórych gatunków bakterii zwanych ekstremofilami. Ekstremolity są to drobnoustroje żyjące w szczególnie trudnych warunkach naturalnych – wysokich temperaturach, skrajnej suchości czy pod wpływem promieniowania ultrafioletowego (w gejzerach, na pustyniach itp.). Ektoina jest substancją chroniącą komórki oraz DNA, dzięki czemu pomaga przetrwać nawet w najmniej korzystnych warunkach atmosferycznych.